## 2.3 二价与分支骨架使核酸酶图谱质控成为强制要求——单靶点路线从不面临这一成本

迄今发表的对该设计范式（design paradigm）最为深入的机制性描述来自src_A06（Nucleic Acids Research 2024，PMID 38187561）：Khvorova/UMass团队构建了一种线性二价分支构建体（di-valent branched construct），将靶向MutS同源物3（MSH3）和亨廷顿蛋白（HTT）的两条不同双链体的正义链，通过标准合成仪上的商业化偶联试剂共价连接。在小鼠中枢神经系统中，该构建体经单次脑室内注射后无需脂质载体，可维持对两个靶点≥2个月的持续沉默，效力与两种独立单靶点二价siRNA的混合物相当[src_A06]。另一对靶点组合（APOE + JAK1）进一步证实该框架可在不同靶点组合间灵活编程[src_A06]。

在肝脏肿瘤应用方面，src_A09报道了一种在大肠杆菌中生物合成的分支多siRNA（GT-multi-siRNA，靶向GP73与hTERT）。该树枝状分支结构无需专用递送载体即可进入Hep3B细胞，单次注射后两周内即可抑制肿瘤生长[src_A09]。生物合成路线可规避单体多样性带来的成本，但会引入批次间序列保真度的挑战，而化学固相合成（solid-phase synthesis）在这方面天然更具优势。

两类构建体共同指向一个关键工艺含义：分支连接点——两条siRNA双链体通过共享正义链连接共价相连之处——形成了一种非标准结构元件，仅凭双链体层面的质谱分析无法确认其完整性。因此，核酸酶P1（在单链区域产生3'-磷酸末端切割）和核糖核酸酶T1（RNase T1，在单链G残基处切割）的图谱分析对这类构建体而言并非补充手段，而是强制要求——它是确认连接点完整性及正确定位的主要分析路径[src_C14]。这是第一类使质控酶从可选表征工具升格为强制放行试剂的设计类别。

**工艺特征（Process signature）**：增加3–5个步骤，增加0–1种特殊单体，核酸酶P1 + 核糖核酸酶T1图谱分析为强制要求，每条链GalNAc价数为2–3。

---
