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kaiandUser <human> 1b47b50d3c v0.6-wip: Python-based Phase 4 translation pipeline
架构变更:把 dr-translator 从 opencode agent 降级为 Python 脚本编排下的 LLM
调用。根本原因是 agent 一次性处理 19k 英文词整文,单次 output token 接近
Sonnet 4.6 上限(~32k),多次重跑都卡在同一个坑里——问题是架构本身,不是
prompt。

新架构:

scripts/lib/zenmux_client.py     HTTP 客户端,指数退避重试、token 统计
                                  JSONL 日志、secrets.env 自动加载
scripts/lib/markdown_chunker.py   按 H1/H2 切块,稳定 anchor ID(order+title
                                  sha1),支持合并/统计
scripts/prompts/translate_system.txt  英译中 prompt,用自定义 <<<TRANSLATION>>>
                                       分隔符格式(规避 Markdown-in-JSON 问题)
scripts/prompts/polish_system.txt     中文润色 prompt(留给下一步 polish.py)
scripts/translate.py              主入口:章节级切块 → 逐块翻译 → 拼接

关键设计:
- 0 依赖 LLM 遵从性:Python 控制切块/循环/重试,LLM 只做单块翻译
- 断点续传:每块翻译完立即写 phase4/zh_chunks/<order>-<anchor>.md
- 术语表累积:每块的 glossary_patch 合并回 phase4/glossary.json
- 失败隔离:单块失败不影响其他块,重跑只补缺
- 调试友好:--only N,M / --limit K / --force

实测(dual-target-rnai-pipeline-2026):
- 63 块全部成功,17 分钟,$1.70
- 33,441 中文字(符合"研究类 ≥30,000 字"硬标准)
- 310 条双语术语
- 翻译质量:接近母语咨询分析师写作

下一步:polish.py(按 H2 section 润色)、merge_chapters.py(从 phase2/drafts
合并生成 final_en.md)、重构 dr-editor-in-chief 调度脚本、更新 /dr-finalize。

Co-authored-by: User <human>
2026-04-22 10:43:43 +08:00

2.6 KiB
Raw Permalink Blame History

3.2 靶点组合聚类:解剖学锁定效应催生心脏代谢单一格局

当前管线由三类靶点组合主导:

  • PCSK9 + APOC3ARO-DIMER-PA(临床阶段);多个中国临床前项目。两种蛋白均由肝细胞独家合成,联合沉默可同时降低LDL-C和高甘油三酯血症 [src_A07]。
  • AGT + PCSK9 或 ANGPTL3 + AGT:BEBT-701(临床阶段);阿尔尼拉姆GEMINI-CVR(pre-IND阶段)。AGT仅在肝脏表达 [src_A14],将其与调脂靶点配对,一针同时干预动脉粥样硬化性心血管疾病(ASCVD)最主要的两大风险因素。
  • 补体靶点组合(CFB + C5CFB + C3:Sirnaomics临床前项目。补体蛋白均在肝脏合成;Argo Biopharma的BW-40202II期)以补体因子B(CFB)为单靶点,验证了补体通路的干预逻辑。

解剖学驱动因素在于:去唾液酸糖蛋白受体(ASGPR)在每个肝细胞上约有500,000个结合位点,内吞循环周期约15分钟 [src_C04]。三价GalNAc簇的结合亲和力(Kd)为5–10 nM,比单价糖高出三个数量级 [src_E07],可将注射剂量的100倍以上富集于肝脏。因此,任何可行的双靶点组合中,两个靶点均须在肝脏表达,否则其中一个靶点将无法获得治疗有效的沉默水平。正是这一解剖学约束,决定了心脏代谢领域的主导地位,也解释了为何中枢神经系统、肌肉和肾脏的双靶点项目至今未能突破临床前阶段。

给药间隔作为化学成熟度的代理指标:每6个月给药一次(Q6M)的目标,要求ASGPR介导的摄取效率和RNA诱导沉默复合体(RISC)装载的持久性均达到较高水平。ARO-ANG3在100 mg剂量下已实现Q3M至Q6M给药 [src_A11];锐博生物RBD5044APOC3 II期)单次注射后6个月随访期内APOC3敲低率维持在84% [src_E25]。上述数据为追求同等给药间隔的双靶点项目设定了化学成熟度基准:须采用三价或更高价态的多价GalNAc簇,并配合成熟的化学修饰模式——这对第8章所分析的亚磷酰胺单体和CPG载体形成直接的需求信号。

中枢神经系统的例外:目前已有一项公开发表的非肝脏单分子双靶点设计——一种靶向MutS同源物3(MSH3)和亨廷顿蛋白(HTT)的二价siRNA骨架,用于中枢神经系统给药(Khvorova/UMass,《核酸研究》2024年;src_A06)。该设计不含GalNAc,不依赖ASGPR,采用分支磷酸二酯骨架经鞘内给药。该项目目前处于研究阶段,尚无临床试验申请(CTA),其制造路线与基于GalNAc的双靶点siRNA完全不同。