kai/deep_research
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1b47b50d3c805eb5d12c0bb57989791110c859b9
deep_research/projects/dual-target-rnai-pipeline-2026/phase4/zh_chunks/004-b004-7427cf69.md
T
kaiandUser <human> 1b47b50d3c v0.6-wip: Python-based Phase 4 translation pipeline 
架构变更：把 dr-translator 从 opencode agent 降级为 Python 脚本编排下的 LLM
调用。根本原因是 agent 一次性处理 19k 英文词整文，单次 output token 接近
Sonnet 4.6 上限（~32k），多次重跑都卡在同一个坑里——问题是架构本身，不是
prompt。

新架构：

scripts/lib/zenmux_client.py     HTTP 客户端，指数退避重试、token 统计
                                  JSONL 日志、secrets.env 自动加载
scripts/lib/markdown_chunker.py   按 H1/H2 切块，稳定 anchor ID（order+title
                                  sha1），支持合并/统计
scripts/prompts/translate_system.txt  英译中 prompt，用自定义 <<<TRANSLATION>>>
                                       分隔符格式（规避 Markdown-in-JSON 问题）
scripts/prompts/polish_system.txt     中文润色 prompt（留给下一步 polish.py）
scripts/translate.py              主入口：章节级切块 → 逐块翻译 → 拼接

关键设计：
- 0 依赖 LLM 遵从性：Python 控制切块/循环/重试，LLM 只做单块翻译
- 断点续传：每块翻译完立即写 phase4/zh_chunks/<order>-<anchor>.md
- 术语表累积：每块的 glossary_patch 合并回 phase4/glossary.json
- 失败隔离：单块失败不影响其他块，重跑只补缺
- 调试友好：--only N,M / --limit K / --force

实测（dual-target-rnai-pipeline-2026）：
- 63 块全部成功，17 分钟，$1.70
- 33,441 中文字（符合"研究类 ≥30,000 字"硬标准）
- 310 条双语术语
- 翻译质量：接近母语咨询分析师写作

下一步：polish.py（按 H2 section 润色）、merge_chapters.py（从 phase2/drafts
合并生成 final_en.md）、重构 dr-editor-in-chief 调度脚本、更新 /dr-finalize。

Co-authored-by: User <human>
2026-04-22 10:43:43 +08:00

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## 术语表
本报告所用技术缩写的中英文对照参考。
| 缩写 | 英文全称 | 中文对应 | 备注 |
|---|---|---|---|
| ADC | Antibody-Drug Conjugate | 抗体偶联药物 | 作为对比引用的非siRNA模式 |
| AGT | Angiotensinogen | 血管紧张素原 | 高血压项目中的siRNA靶点（如阿尔尼拉姆zilebesiran） |
| AJIPHASE | Ajinomoto Liquid-Phase Synthesis Platform | 味之素液相合成平台 | 用于寡核苷酸合成的可溶性标签液相寡核苷酸合成（LPOS）技术 |
| ALE | Adaptive Laboratory Evolution | 适应性实验室进化 | 用于改造酶以掺入修饰NTP的策略 |
| ANGPTL3 | Angiopoietin-Like 3 | 血管生成素样3 | 降脂siRNA靶点（Arrowhead ARO-ANG3） |
| APOC3 | Apolipoprotein C-III | 载脂蛋白C-III | 降甘油三酯siRNA靶点 |
| ASGPR | Asialoglycoprotein Receptor | 去唾液酸糖蛋白受体 | GalNAc靶向的肝细胞受体 |
| BEBT-701 | BeBetter Therapeutics dual-target asset | 百奥斯BEBT-701 | 中国临床前双靶点项目 |
| BLA | Biologics License Application | 生物制品上市许可申请 | FDA商业上市审批途径 |
| CAGR | Compound Annual Growth Rate | 复合年均增长率 | 市场增长指标 |
| CDMO | Contract Development and Manufacturing Organization | 合同研发生产组织 | 外包制药生产商 |
| CDE | Center for Drug Evaluation (NMPA) | 国家药品监督管理局药品审评中心 | 中国药品审评机构 |
| CDER | Center for Drug Evaluation and Research (FDA) | 美国FDA药品评价与研究中心 | FDA药品监管机构 |
| CFB | Complement Factor B | 补体因子B | 补体通路siRNA靶点 |
| CIP | Calf Intestinal Alkaline Phosphatase | 小牛肠碱性磷酸酶 | 用于去磷酸化的质控酶 |
| CLEA | Cross-Linked Enzyme Aggregates | 交联酶聚集体 | 无载体固定化酶形式 |
| CMC | Chemistry, Manufacturing, and Controls | 化学、制造与控制 | 药品质量申报文件章节 |
| CNS | Central Nervous System | 中枢神经系统 | 部分siRNA项目的递送靶部位 |
| CPG | Controlled-Pore Glass | 可控孔径玻璃 | 传统固相合成载体 |
| CRL | Complete Response Letter | 完全答复函 | FDA含缺陷说明的拒绝函 |
| CuAAC | Copper-Catalyzed Azide–Alkyne Cycloaddition | 铜催化叠氮–炔烃环加成 | 需控制铜残留的点击化学变体 |
| DBCO | Dibenzocyclooctyne | 二苯并环辛炔 | 与应变促进叠氮–炔烃环加成（SPAAC）兼容的张力环辛炔基团 |
| DES | Deep Eutectic Solvent | 深共熔溶剂 | 用于酶催化的绿色溶剂 |
| DMF | Drug Master File | 药物主文件 | FDA/EMA供应商质量备案文件 |
| ECO | Enzymatic Codexis Oligonucleotide platform | Codexis酶法寡核苷酸平台 | Codexis酶法链合成/连接平台 |
| EMA | European Medicines Agency | 欧洲药品管理局 | 欧盟监管机构 |
| FDA | U.S. Food and Drug Administration | 美国食品药品监督管理局 | 美国监管机构 |
| FXI | Factor XI (coagulation) | 凝血因子XI | 抗凝siRNA靶点 |
| GalNAc | N-Acetylgalactosamine | N-乙酰半乳糖胺 | 肝细胞靶向糖基配体 |
| GMP | Good Manufacturing Practice | 药品生产质量管理规范 | 生产质量标准 |
| GT | Glycosyl-Transferase | 糖基转移酶 | 用于糖基偶联的酶类 |
| HCP | Host-Cell Protein | 宿主细胞蛋白 | 重组酶生产过程中的残留杂质 |
| HPLC | High-Performance Liquid Chromatography | 高效液相色谱 | 纯度分析技术 |
| HTT | Huntingtin | 亨廷顿蛋白 | 亨廷顿病siRNA项目靶点 |
| ICH | International Council for Harmonisation | 国际协调会议 | 全球药品协调机构 |
| IND | Investigational New Drug | 新药临床试验申请 | FDA/国家药品监督管理局临床试验申请 |
| ISO | International Organization for Standardization | 国际标准化组织 | 工业标准机构（ISO 13485用于酶GMP引用） |
| IVT | In Vitro Transcription | 体外转录 | 无细胞RNA合成方法 |
| LC-MS | Liquid Chromatography–Mass Spectrometry | 液相色谱–质谱联用 | 寡核苷酸鉴别/纯度检测方法 |
| LNA | Locked Nucleic Acid | 锁核酸 | 用于增强亲和力的双环修饰核糖 |
| LPOS | Liquid-Phase Oligonucleotide Synthesis | 液相寡核苷酸合成 | 可溶性载体合成策略 |
| MSH3 | MutS Homolog 3 | MutS同源物3 | DNA修复基因；HTT双靶点协同靶点 |
| NEB | New England Biolabs | 新英格兰生物实验室 | 领先的GMP级分子酶供应商 |
| NMPA | National Medical Products Administration (China) | 国家药品监督管理局 | 中国药品监管机构 |
| NTP | Nucleoside Triphosphate | 核苷三磷酸 | 体外转录底物 |
| PAT | Process Analytical Technology | 过程分析技术 | 在线过程监控框架（ICH Q8/Q13） |
| PCSK9 | Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin type 9 | 前蛋白转化酶枯草溶菌素/Kexin 9型 | 降低LDL-C的siRNA靶点 |
| PDE | Permitted Daily Exposure | 每日允许暴露量 | ICH Q3D元素杂质限量 |
| PNK | Polynucleotide Kinase (T4) | 多核苷酸激酶（T4） | 连接工作流中的5′-磷酸化酶 |
| Q3D | ICH guideline for elemental impurities | ICH关于元素杂质的指导原则 | 规定包括铜在内的金属每日允许暴露量 |
| Q11 | ICH guideline on drug substance development | ICH关于原料药开发与生产的指导原则 | 原料药起始物料定义 |
| Q13 | ICH guideline on continuous manufacturing | ICH关于连续制造的指导原则 | 适用于酶法流动合成 |
| QC | Quality Control | 质量控制 | 分析放行流程 |
| RADS | Ribonucleic Acid Delivery System (Argo) | 舶望RNA递送系统 | Argo Biopharma专有GalNAc-siRNA化学平台 |
| RISC | RNA-Induced Silencing Complex | RNA诱导沉默复合体 | siRNA作用的效应复合体 |
| RNase T1 | Ribonuclease T1 | 核糖核酸酶T1 | 鸟苷特异性质控内切核酸酶 |
| RNAi | RNA Interference | RNA干扰 | siRNA介导的转录后基因沉默机制 |
| SC | Subcutaneous | 皮下给药 | GalNAc-siRNA典型给药途径 |
| SPAAC | Strain-Promoted Azide–Alkyne Cycloaddition | 应变促进叠氮–炔烃环加成 | 无铜点击化学替代方案 |
| SPOS | Solid-Phase Oligonucleotide Synthesis | 固相寡核苷酸合成 | 在可控孔径玻璃/聚合物上进行的标准亚磷酰胺合成 |
| SUGAR-TARGET | Immobilized glycosyltransferase cascade (Merck / Nat Chem Biol 2023) | 固定化糖基转移酶级联 | 已发表的糖基转移酶级联平台 |
| SVPD | Snake Venom Phosphodiesterase | 蛇毒磷酸二酯酶 | 用于寡核苷酸图谱分析的3′-外切核酸酶 |
| TIDES | TIDES USA/Europe oligonucleotide & peptide conference | TIDES寡核苷酸与多肽会议 | 工艺信息披露的行业会议 |
| TRL | Technology Readiness Level | 技术成熟度等级 | NASA/ESA技术成熟度1–9级评估体系 |
| TdT | Terminal Deoxynucleotidyl Transferase | 末端脱氧核苷酸转移酶 | 用于酶法寡核苷酸合成的非模板依赖性DNA聚合酶 |
| USP | United States Pharmacopeia | 美国药典 | 法定标准机构 |
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