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deep_research/projects/dual-target-rnai-pipeline-2026/phase4/zh_chunks/043-b043-091eb594.md
T
kaiandUser <human> 1b47b50d3c v0.6-wip: Python-based Phase 4 translation pipeline
架构变更:把 dr-translator 从 opencode agent 降级为 Python 脚本编排下的 LLM
调用。根本原因是 agent 一次性处理 19k 英文词整文,单次 output token 接近
Sonnet 4.6 上限(~32k),多次重跑都卡在同一个坑里——问题是架构本身,不是
prompt。

新架构:

scripts/lib/zenmux_client.py     HTTP 客户端,指数退避重试、token 统计
                                  JSONL 日志、secrets.env 自动加载
scripts/lib/markdown_chunker.py   按 H1/H2 切块,稳定 anchor ID(order+title
                                  sha1),支持合并/统计
scripts/prompts/translate_system.txt  英译中 prompt,用自定义 <<<TRANSLATION>>>
                                       分隔符格式(规避 Markdown-in-JSON 问题)
scripts/prompts/polish_system.txt     中文润色 prompt(留给下一步 polish.py)
scripts/translate.py              主入口:章节级切块 → 逐块翻译 → 拼接

关键设计:
- 0 依赖 LLM 遵从性:Python 控制切块/循环/重试,LLM 只做单块翻译
- 断点续传:每块翻译完立即写 phase4/zh_chunks/<order>-<anchor>.md
- 术语表累积:每块的 glossary_patch 合并回 phase4/glossary.json
- 失败隔离:单块失败不影响其他块,重跑只补缺
- 调试友好:--only N,M / --limit K / --force

实测(dual-target-rnai-pipeline-2026):
- 63 块全部成功,17 分钟,$1.70
- 33,441 中文字(符合"研究类 ≥30,000 字"硬标准)
- 310 条双语术语
- 翻译质量:接近母语咨询分析师写作

下一步:polish.py(按 H2 section 润色)、merge_chapters.py(从 phase2/drafts
合并生成 final_en.md)、重构 dr-editor-in-chief 调度脚本、更新 /dr-finalize。

Co-authored-by: User <human>
2026-04-22 10:43:43 +08:00

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1.6 KiB
Markdown

## 7.3 酶连接技术催生新一轮需求激增
阿尔尼拉姆斥资2.5亿美元建设siRELIS工厂(2025年12月)、Codexis与Nitto Denko Avecia签署ECO Synthesis评估协议(2025年10月),以及兆维完成首批商业化GMP级酶连接siRNA生产——这三件事共同表明,化学酶法组装正式走出中试阶段[src_B16, src_H04]。每个平台都从三个具体维度改变了质控用酶的需求结构。
其一,**过程内DNase I**用量从质控检测规模跃升至批次生产规模。DNA夹板连接路线需对每批GMP产品进行DNase I处理以去除DNA夹板,该过程内步骤的酶用量是分析质控检测的10至100倍[src_B16]。
其二,**T4多核苷酸激酶(T4 PNK)用量趋近化学计量级**。连接酶底物需要5'-磷酸末端,而化学合成片段携带的是5'-OH末端。一条21聚体siRNA中每个约7聚体片段均需一次PNK反应,每条双链共需六次,用量随批次规模和片段数量线性增长[src_E42, src_B16]。
其三,**连接位点验证检测属于全新质控类别**。每个连接位点均须通过专项核糖核酸酶T1与核酸酶P1联合再消化加以确认——该消化可生成跨越封接位点的片段,再结合精确质量液相色谱-质谱(LC-MS)进行分析[src_H01]。一条由两条链各三个片段组装而成的双靶点siRNA,最多含四个连接位点,每个位点均需独立验证——这一质控检测类别在纯固相合成生产中毫无对应先例。以酶连接法生产每摩尔双靶点原料药计,质控用酶总消耗量约为等量固相合成(SPOS)批次的2至3倍[src_B16, src_E42]。